האפיפיור הנוכחי הביע סייגים בנוגע להומוסקסואליות במוסדות הכנסייה הקתולית ברחבי העולם. לדבריו, אין מקום להומואים ולסביות בדרגות הכנסייה. הדברים נאמרו בראיון ארוך במיוחד שערך הכומר הספרדי בן למשפחה מיוחסת פרננדו פראדו, תחת הכותרת "עוצמת השליחות". בראיון התייחס פרנציסקוס לסוגית ההומואים והלסביות בתפקידים בכנסיה הקתולית.
"הנושא מדאיג אותי", אמר האפיפיור פרנציסקוס, "מוטב לאנשים עם נטיות מושרשות שלא יתקבלו לכמורה ולחיי נזירות". הביטוי מתייחס לכמרים ולנזירות קתוליות. הראיון אמור להתפרסם כספר במהלך השבוע, ועותק נשלח מראש למגזין רויטרס, שפרסם את הידיעה.
את העניין הגדיר פרנציסקוס "כסוגיה רצינית", והבהיר שאלו המחפשים להצטרף לדרגות הכמורה יאלצו לוודא שהינם "בוגרים רגשית ונפשית", לפני שיוכלו להיסמך לכמורה. להומואים ולסביות הכבר מכהנות בכנסיה אמר, "מוטב להם לעזוב את הכמורה והנזירות מאשר לחיות חיים כפולים", והוסיף שעליהם להמשיך ולהתנזר.
אבי הכנסייה הקתולית נרשם בהיסטוריה כאפיפיור עם העמדה האדיבה ביותר כלפי להט"בים בכל הזמנים של הכנסייה הקתולית. הוא לא רואה בלהט"בים פסול מצד אחד, אך מאידך מעדיף שלא יאיישו תפקידים בכנסייה על מנת שלא יחיו חיים כפולים.
>> ה"כמסקס" כובש את תל אביב - ויש סיבה לדאגה
>> "הומואים לא מפרגנים להומואים חתיכים ומצליחים"
>> "לפעמים הוא מפחד שיקראו למשטרה על פדופיליה"
בנוגע לקבוצת השפעה להט"בית בכנסייה אמר בעבר, "מי אני שאשפוט", ומוקדם יותר השנה בראיון אישי עם נפגע של התעללות מינית מידי כומר, אמר לבחור שהוטרד בילדותו "זה לא משנה שאתה הומו. ככה אלוהים ברא אותך, והוא אוהב אותך כך, וכמוהו גם האפיפיור אוהב אותך".
כיום הכנסייה הקתולית ישרה קו עם זרמים מרכזים בדתות האברהמיות, ואינה טוענת עוד שלהיות בעל נטיות הומוסקסואליות זה רע כשלעצמו, אמנם כן מגדירה מין בין גברים כחטא.