מיד אחרי ההפיכה באירן ב-1979, האייתוללה חומייני ניתק את הקשרים של המדינה עם ישראל וקרא לשחרור פלסטין וירושלים מידי המשטר הציוני. חומייני כינה את ישראל "השטן הקטן", ומאז אירן מציינת בכל שנה את "יום ירושלים" במחאה נגד הממשל הציוני.
לסיפורים הכי מעניינים והכי חמים – הצטרפו לפייסבוק שלנו
מאז 1979 אירן קוראת למחיקת ישראל, מארגנת אירועים להכחשת השואה ומתייצבת לצידן של מדינות או ארגונים שמתנגדים לישראל כמו ארגון חיזבאללה בלבנון וארגון חמאס ברצועת עזה. אירן מעורבת גם בפיגועים נגד מטרות מזוהות עם ישראל כמו הפיגועים בארגנטינה בשנות ה-90'.
כבר בשנות ה-90' החלה ישראל להוביל את המאבק בתכנית הגרעין האירנית - מאבק דיפלומטי שמלווה בעבודת מודיעין, משימות מסתוריות שמיוחסות לישראל ואיומים בתקיפה צבאית.
במסגרת מלחמת האזרחים בסוריה הנשיא אסד הזמין סיוע מבני בריתו בטהרן, ואנשי משמרות המהפכה האירנים הגיעו למדינה בהמוניהם. לצד התמיכה באסד, אירן הקימה בסיסים בשטח המדינה - בסיסים שעשויים לשמש את המשטר האירני במתקפות נגד ישראל.
ב-18 בינואר 2015 תקפו מסוקי קרב שיירה של חיזבאללה בשטח הגולן הסורי: 6 לוחמי משמרות המהפכה כולל שני קצינים בכירים ו-6 לוחמי חיזבאללה נהרגו במתקפה שיוחסה בתקשורת הבינלאומית לישראל. 20 יום אחר כך שני חיילי גבעתי נהרגו מירי טילים של חיזבאללה לעבר כוח צה"ל. בתחילת דצמבר 2015 בסיס אירני סמוך לדמשק הותקף, 10 חיילים במקום - סורים ואירנים - נהרגו
בשנתיים האחרונות המתיחות התגברה: על פי הדיווחים חיל האוויר ערך יותר מ-120 מתקפות על שיירות נשק מאירן לחיזבללה וארגונים אחרים. ירושלים מצידה לא הודתה שביצעה את התקיפות בעומק שטח האויב.
ב-2018 העוינות הישירה בין המדינות עלתה מדרגה: ב-10 בפברואר 2018 כלי טיס בלתי מאויש איראני חודר לישראל ומיורט. בתגובה חיל האוויר הפציץ את הבסיס שממנו הופעל כלי הטיס, נמל התעופה הצבאי שידוע בשם T-4. אחד המטוסים התוקפים נפגע מירי נ"מ של צבא סוריה, צה"ל הגיב בתקיפת 12 מטרות בעומק שטחה של סוריה.
ב-9 באפריל השנה דווח על תקיפה אווירית נוספת בשדה התעופה T-4. לפי הדיווחים, 7 חיילים אירנים ו7 חיילים סורים נהרגו בתקיפה הזו שכוונה נגד מתקן צבאי אווירי אירני. ב-12 באפריל עלי שיראזי, יועץ בכיר למנהיג אירן האייתוללה עלי חמינאי, הזהיר את ישראל ש"לא תבצע צעדים טיפשיים ושלא תיתן לאירן תירוצים להשמיד תל אביב וחיפה"
ב-20 באפריל סגן מפקד משמרות המהפכה, חוסיין סלאמי, אמר: "אין לכם מקום לברוח - אתם חיים בפיו של הנחש... המקום היחיד שאתם יכולים לברוח אליו הוא הים".
וגם ישראל שיגרה מסרים מאיימים: ב-26 באפריל שר הביטחון אביגדור ליברמן הזהיר כי "אם אירן תתקוף את תל אביב, ישראל תתקוף את טהרן ותהרוס כל מוצב צבאי אירני בסוריה שמאיים על ישראל".
ב-29 באפריל הותקפו מהאוויר בסיסים צבאיים ומחסני תחמושת אירניים בשטחה של סוריה: עשרות נהרגו במתקפה הזו, בהם לפחות 11 אנשי משמרות המהפכה. ישראל לא לקחה אחריות למתקפה.
יממה לאחר מכן ראש הממשלה בנימין נתניהו נשא נאום דרמטי ובו הוא חשף מידע מודיעיני שנאסף על ידי המוסד - ובו מוצגת חתירתה של אירן להשיג נשק גרעיני למרות הסכם הגרעין עם המערב.
אמש, אחרי הודעת טראמפ על פרישה מהסכם הגרעין, אמר נתניהו: "אנחנו נגיב בעוצמה על כל פגיעה בשטחנו. הצבא מוכן, הצבא חזק, ומי שינסה אותנו ירגיש היטב את נחת זרוענו". זמן קצר לאחר מכן הותקף, לפי פרסומים זרים, מתקן צבאי אירני - ולפחות 8 מאנשי משמרות המהפכה נהרגו.