בצל שני הפיגועים הקשים בירושלים בסוף השבוע, ראש האופוזיציה יאיר לפיד תקף הערב (שבת) באולפן את ההתנהלות של השר לביטחון לאומי בן גביר והמתקפה על היועמ"שית: "זה קשקוש מסוכן ואני עדין. אתה כבר לא צייצן טוויטר, כבר לא שר לענייני מסיבות עיתונאים. אתה השר לביטחון לפנים. הגיע הזמן שהממשלה תבין שהיא הגורם האחראי. הם צריכים לעשות את העבודה שלהם במקום להתלהם, ואת מה שיש לכם להציע - מציעים בקבינט. לא לעמוד ולצעוק, או לעשות את מה שהם עושים תמיד - לחפש אשמים".
"נכון לצאת ולהפגין בשבת כזו", הוסיף לפיד, "הממשלה צריכה להחליט אם היא רוצה להילחם בטרור או בדמוקרטיה הישראלית. הם צריכים לעצור את החקיקה המטורפת שמכרסמת בדמוקרטיה הישראלית ובחוסן הישראלי, ולהעביר את הנושא לידיו האמונות של הנשיא - שהוא יכין את התוכנית המשפטית, אם צריך אחת כזו. אנחנו ניתן להם גיבוי מלא לכל לחימה בטרור. אני לא סומך על נתניהו, מזכיר שראש הממשלה מתמודד מול שלושה תיקים חמורים, ואני כן סומך על הרצוג, שהוא משפטן מוכשר, על מנת להקים ועדה נשיאותית שתטפל בשינויים אפשריים במערכת המשפט. אין מערכת שאי אפשר לתקן ולשפר אותה, אבל צריך לעשות את זה בתהליך שלא זוהם באינטרסים ובעיות אישיות".
עימות חריג נרשם במהלך השבת בין השר בן גביר לבין היועצת המשפטית לממשלה גלי בהרב-מיארה. בן גביר דרש לאטום מיידית את בית המחבל מהפיגוע בבית הכנסת בירושלים, אולם היועמ"שית ביקשה לבדוק קודם את הנושא - שיעלה הערב בקבינט המדיני-ביטחוני. בהצהרה לתקשורת אמר בן גביר: "מהרגע ששמעתי על הפיגוע בבית הכנסת, באותן דקות היה לי ברור שצריך לעשות מעשה. באתי עם שני בג"צים שאני מכיר, יחד קבענו דיון עם ראש השב"כ, המפכ"ל וכל גורמי הביטחון. קיבלנו החלטה לאטום את הבית על מנת לשדר מסר מאוד ברור. ביקשתי מהשב"כ חוות דעת ברורה והדברים האלה נחתו על שולחנה של היועמ"שית בשמונה בבוקר. ציפיתי ששעה אחר כך יהיה לנו אישור לאטום את הבית. לתדהמתי עד לרגע זה היועמ"שית לא מאפשרת לנו לעשות זאת. בעיניי זה נורא, זה לא יכול להיות, זה לפגוע לא רק בי ובממשלה - אלא גם באזרחי ישראל".
בתגובה על פרסום הבקשה של השר בן גביר, אשר לכאורה נדחתה על ידי היועמ"שית, נמסר מטעמה בתגובה כי הפרסום שגוי: "כפי שהובהר לשר בן גביר על ידי גורמי המקצוע ברשויות הביטחון ובמשרד המשפטים, החלטות פעולה של הדרג המדיני צריכות להיתמך בתשתית עובדתית, ועליו להציגה. בהתאם לכך, רק לפני שעה הועברה ליועצת המשפטית לממשלה השלמת חוות הדעת הבטחוניות, ואלה נבדקות כעת. היועצת המשפטית לממשלה תתייחס בקבינט לכלל הנושאים שיעלו ותעשה כל שניתן כדי לספק כלים משפטיים שיאפשרו את הגשמת מדיניות הדרג המדיני".