כביש 55 בשומרון שבו נרצחו הבוקר (שני) שלושה בני אדם בפיגוע הירי משמש נוסעים רבים, גם ישראלים וגם פלסטינים. מדובר בכביש מרכזי שמוביל לקדומים. בשעות הבוקר ואחר הצוהריים הכביש עמוס מאוד ולכן צה"ל מאבטח אותו. כפר אל-פונדוק נחשב שקט מאוד וישראלים רבים עוצרים בדרך לעשות בו קניות.
בצה"ל אמרו כי העמדה הצבאית בכניסה לכפר לא מאוישת 24 שעות ביממה, אלא בשעות העומס. החיילים עזבו את העמדה בכניסה לכפר כחצי שעה לפני הפיגוע. בתיעוד מהפיגוע נראה מחבל אורב לאוטובוס, יוצא במהירות מרכב ופותח באש.
ככל הנראה המחבלים הגיעו משכם ולפי החשד לשם הם נמלטו לאחר הפיגוע. כוחות ביטחון רבים פתחו במצוד אחריהם. בנוסף, נפרסו מחסומים וכתרים בשכם ובכפרים נוספים באזור.
עמי ברבר, תושב עמנואל שנסע בכביש וירה לעבר המחבלים, סיפר: "שמעתי ירי מטורף, חתרתי למגע לכיוון הירי, יריתי לעבר מקור הירי אבל האוטובוס הפריע לי. יריתי לעבר אחד מהם, ראיתי שתי נשים הרוגות. המשכתי וראיתי נהג עם שתי פגיעות ירי".
המתנחלים זעמו אחרי הפיגוע. ממועצת יש"ע נמסר: "כמה עוד נזעק? כמה עוד נדרוש? איראן מתבססת ביהודה ושומרון וממשלת ישראל וצה"ל לא משנים אסטרטגיה. אנחנו אבלים בבוקר קשה זה על הירצחם של אזרחים תמימים, מתפללים לשלום הפצועים ודורשים לכתוש ולהכריע את הטרור האיראני. שכם צריכה להיראות כמו עזה. ג'נין כמו דרום לבנון".
ראש המועצה האזורית שומרון יוסי דגן אמר אחרי הפיגוע כי "אנחנו דורשים מכם לסגור עכשיו את כל המחסומים. אם המחסומים הביטחוניים היו סגורים והיו מתבצעות בדיקות לכל מי שיוצא ונכנס לשכם - אולי הפיגוע הזה לא היה קורה, ואם היה קורה - המחבל לא היה יכול לברוח לשכם".
דגן הוסיף כי "אנחנו דורשים מהממשלה ומהפיקוד הבכיר בצה"ל לצאת מהקונספציה מול הרשות הפלסטינית, להחרים את כל כלי הנשק הבלתי חוקיים ולהתחיל להילחם באבו מאזן שמבצע את הטרור הזה. הדם של האחים שלנו כאן על הכביש זועק והפיגועים האלה יכולים להימנע. אנחנו דורשים ביטחון".
שר האוצר בצלאל סמוטריץ', תושב קדומים, אמר כי "הקונספציה עדיין כאן והיא עולה בדם יקר. הטרור ביהודה ושומרון והטרור מעזה ואיראן הוא אותו טרור - וצריך להכריע אותו. מי שסומך על הרשות הפלסטינית שתשמור על ביטחון אזרחי ישראל מתעורר לבוקר שבו שוב טובחים מחבלים בתושבים יהודים. פונדוק, שכם וג'נין צריכות להיראות כמו ג'באליה כדי שכפר סבא לא תהיה כפר עזה חלילה". סמוטריץ' הוסיף: "דורש מראש הממשלה כינוס דחוף של הקבינט עוד היום לדיון בשינוי תפיסה ולמיגור אמיתי של הטרור ביהודה ושומרון".
ראש הממשלה בנימין נתניהו אמר אחרי הפיגוע: "רעייתי ואני שולחים תנחומים מעומק הלב למשפחות שלושת הנרצחים מהפיגוע הנורא הבוקר, ומאחלים איחולי החלמה מלאה לנפגעים. נגיע למרצחים הנתעבים ונבוא חשבון איתם ועם כל מי שסייע להם. אף אחד לא ינקה".
הפיגוע התרחש בסביבות השעה 09:20. שני מחבלים לפחות ירו לעבר אוטובוס וכלי רכב פרטיים סמוך לקדומים - ונמלטו מהמקום. כוחות רבים פתחו במרדף אחריהם.
מד"א עדכן כי בתום מאמצי החייאה, נאלצו הצוותים לקבוע את מותם של שתי נשים כבנות 60 וגבר כבן 40. נהג האוטובוס, בן 63, נפצע קשה בפיגוע. שבעה מנוסעי האוטובוס נפצעו, בהם שתי נשים כבנות 60 ו-70 במצב בינוני. מצבם של יתר הפצועים קל.