מבצע החילוץ הלילי להשבת גופתו של אלעד קציר ז"ל נמשך שעות לתוך הלילה (בין שישי לשבת). כוחות מיחידת הקומנדו, שפועלים באזור ח'אן יונס זה כמה שבועות, קיבלו מידע מודיעני על המיקום המדויק שבו הוסתרה הגופה. בתוך זמן קצר הם יצאו לפעולה מיוחדת, יחד עם גדוד 82 של השריון, יחידת אגוז וסיירת צנחנים – כשהיעד נמצא בלב מחנה הפליטים הצפוף ברצועת עזה.
הכוחות עשו את דרכם במהירות בסמטאות הצפופות. הם נפרסו בשני מעגלים עיקריים כשהכוח המוביל היו לוחמי יחידת מגלן שפעלה לאיתור הגופה, שאר היחידות איבטחו אותה. בפאתי מחנה הפליטים אומנם זוהו מחבלים ואירעו חילופי ירי, אך האזור שבו הוסתרה הגופה בודד. בפעילות מיוחדת, שכללה חפירה – אותרה גופתו של אלעד. משם היא הועברה לישראל, ולזיהוי רשמי.
המידע העיקרי באשר למיקום גופתו נחשף בחקירות של פעילי הג'יהאד האיסלאמי שנתפסו בשיפא ובח'אן יונס, והגיע למערכת הביטחון רק בימים האחרונים. ההערכה היא שאלעד נרצח בידי שוביו כבר בחודש ינואר, ומאז גופתו הוסתרה ברצועת עזה. אלעד נחטף בחיים ותועד בשבי לפחות פעמיים בסרטונים שהופצו כחלק מהתעמולה של ארגון הטרור, ובו ביקש לשחררו.
אחותו של אלעד, כרמית פלטי קציר, פרסמה פוסט עם היוודע הירצחו. "אלעד נחטף מביתו בניר עוז חי ושלם וצולם פעמיים מתוך השבי. ניתן היה להציל אותו לו עסקה הייתה קורית בזמן. המנהיגות שלנו פחדנית ומונעת משיקולים פוליטיים ולכן זה לא קרה", כתבה. "לא ככה הסיפור שלך ושלנו היה צריך להסתיים. סליחה שלא הצלחנו להציל אותך".