חילופי אש התפתחו הלילה (בין רביעי לחמישי) בין חמושים פלסטינים לבין כוחות צה"ל שאבטחו מתפללים יהודים שהיו בדרכם לקבר יוסף שבשכם. בתיעודים שהגיעו מהמקום, נראים הפלסטינים משליכים מטענים לעבר הכוחות - מה שמוביל לפיצוץ עז. משרד הבריאות הפלסטיני דיווח על הרוג אחד מחילופי האש, ועל ארבעה נוספים שנפצעו - שניים מהם במצב קשה.
העימותים החלו בשעות הלילה המוקדמות, לאחר שמתפרעים הבעירו צמיגים וחסמו כבישים בשכם - לקראת כניסת המתפללים היהודים לקבר יוסף. בזמן העימותים, כוחות צה"ל אבטחו כ-40 אוטובוסים שבהם ישבו המתפללים.
בתיעוד נוסף שהגיע משכם הלילה, נראים עשרות פלסטינים משליכים אבנים ויורים זיקוקים סמוך לקבר יוסף - עם כניסת כוחות צה"ל למקום. זאת כשבמקביל, חולפים רכבים במקום ללא הפרעה.