עימות חריג נרשם במהלך השבת בין השר לביטחון לאומי איתמר בן גביר לבין היועצת המשפטית לממשלה גלי בהרב-מיארה. בן גביר דרש לאטום מיידית את בית המחבל מהפיגוע בבית הכנסת בירושלים, אולם היועמ"שית ביקשה לבדוק קודם את הנושא - שיעלה הערב (שבת) בקבינט המדיני-ביטחוני.
בהצהרה לתקשורת אמר בן גביר: "מהרגע ששמעתי על הפיגוע בבית הכנסת, באותן דקות היה לי ברור שצריך לעשות מעשה. באתי עם שני בג"צים שאני מכיר, יחד קבענו דיון עם ראש השב"כ, המפכ"ל וכל גורמי הביטחון. קיבלנו החלטה לאטום את הבית על מנת לשדר מסר מאוד ברור. ביקשתי מהשב"כ חוות דעת ברורה והדברים האלה נחתו על שולחנה של היועמ"שית בשמונה בבוקר. ציפיתי ששעה אחר כך יהיה לנו אישור לאטום את הבית. לתדהמתי עד לרגע זה היועמ"שית לא מאפשרת לנו לעשות זאת. בעיניי זה נורא, זה לא יכול להיות, זה לפגוע לא רק בי ובממשלה - אלא גם באזרחי ישראל. קיימנו דיון טלפוני אחר הצהריים ונתניהו הסכים איתי שצריך לאטום גם את הבית של המחבל השני מהפיגוע בעיר דוד".
בתגובה על פרסום הבקשה של השר בן גביר, אשר לכאורה נדחתה על ידי היועמ"שית, נמסר מטעמה בתגובה כי הפרסום שגוי: "כפי שהובהר לשר בן גביר על ידי גורמי המקצוע ברשויות הביטחון ובמשרד המשפטים, החלטות פעולה של הדרג המדיני צריכות להיתמך בתשתית עובדתית, ועליו להציגה. בהתאם לכך, רק לפני שעה הועברה ליועצת המשפטית לממשלה השלמת חוות הדעת הבטחוניות, ואלה נבדקות כעת. היועצת המשפטית לממשלה תתייחס בקבינט לכלל הנושאים שיעלו ותעשה כל שניתן כדי לספק כלים משפטיים שיאפשרו את הגשמת מדיניות הדרג המדיני".
על דברים אלה השיב בן גביר: "חוות הדעת של השב"כ הועברה ליועמ"שית בשמונה בבוקר. לתדהמתי מאז ועד עכשיו, היא ואנשיה עסוקים בפלפולים משפטיים, ומבקשים מהשב"כ עוד ועוד השלמות מיותרות. היה צריך לאפשר לנו לאטום את הבית בשמונה בבוקר ולא לחכות עד עכשיו. מזכיר שוב שהמשטרה אמרה לי שלא תוכל להשאיר כוחות בבית ואם לא יתאפשר להרוס את הבית, הכוחות יאלצו לעזוב את המקום".
בדבריו פירט השר לביטחון לאומי על שורה של צעדים נוספים שביקש להוציא לפועל: "יש את עניין הריסות הבתים. יש עשרות בתים במזרח ירושלים שאפשר להרוס והנחיתי את המשטרה להרוס את הבתים הבלתי חוקיים. פרט לכך, יש את עניין הנשקים - אזרחים יכולים להגן על עצמם וצריך לאפשר לאזרחים שרוצים ומתאימים להחזיק נשק. מחר בישיבת הממשלה אני מתכוון לבקש פטור מחובת הנחה לחוק עונש מוות למחבלים. זה חוק ראוי". עוד דיבר בן גביר על הרפורמה שהוא מעוניין לקדם במשטרה: "משמר לאומי שיוקם כבר מחר בבוקר. אני מבקש לאפשר לי כבר עכשיו לקבל תקנים למשמר הלאומי".