מפכ"ל המשטרה רב ניצב קובי שבתאי אמר בשיחות סגורות כי אינו יודע להצביע על פעולה שהיה מבצע אחרת בהקשר לאסון במירון. בשיחה עם מקורביו אמר המפכ"ל שבתאי כי טיפל בכל נושא שעליו היה אחראי או שבה נדרשה מעורבתו. הוא הוסיף כי נדרשת לכל הפחות הקמת ועדת בדיקה בראשות שופט לאסון - אך זו לא יכולה להיות בדיקה של מבקר המדינה.
באותה שיחה ציין מפכ"ל המשטרה שהוא לא רואה שום בעיה בהמשך תפקודם של כל מי שהיו מעורבים מקרב השוטרים והמפקדים באסון בכל הדרגים. לדבריו, כולם יכולים וצריכים להמשיך לכהן בתפקידיהם ורק אם יימצאו או יתבררו ממצאים אחרים - יתקבלו החלטות בהתאם.
בדיון של סגל הפיקוד הבכיר של המשטרה שנערך שלשום החליט המפכ"ל יעקב שבתאי לשלוח מכתב ליועמ"ש ובו בקשה להקים ועדת חקירה ממלכתית לבדיקת נסיבות האסון במירון. אלא שהשר אוחנה שהגיע לפגישה בשלב מסוים, מנע מהמפכ"ל את הגשת הבקשה הזו.
בעקבות זאת, ספג המפכ"ל ביקורת קשה מבכירי המשטרה: "ההתקפלות של המפכ"ל בעקבות שיחה עם השר אוחנה נראית כמו כניעה מבישה והתקפלות של הדרג המבצעי בפני הדרג הפוליטי", תקף אחד הקצינים המכהנים. מפכ"ל משטרה בדימוס אמר על ההתקפלות: "אם המפכ"ל שבתאי לא יתעשת ויפגין עצמאות מול השר שמינה אותו – הוא יאבד את התמיכה של הציבור ושל השוטרים".