גם מבקר המדינה מיכה לינדנשטראוס יבדוק את אירועי המשט לעזה - בלי קשר לוועדת הבדיקה שהקימה הממשלה. בהודעה רשמית שיצאה היום ממשרדו נכתב שהמבקר יבחן היבטים שונים בהם: קבלת ההחלטות המודיעין וההסברה הישראלית. עם זאת, הוא לא יחקור את הפעולה הצבאית עצמה והיבטיה המשפטיים – אלו ייבחנו ע"י ועדת טירקל