בדיקת אולטרסאונד שמתבצעת בשבוע 12-14 של ההיריון. בבדיקה מודדים את עובי הנוזל שהצטבר בעורף העובר. הצטברות גדולה מדי של נוזלים עשויה להעיד על סיכון מוגבר למומים כרומוזומליים כמו תסמונת דאון, מומים מבניים כמו מומי לב והפרעות גנטיות נדירות בעובר. הבדיקה היא בדיקת סקר סטטיסטית ומצביעה על סיכוי להימצאות פגם, כך שלא מתקבלת תוצאה ודאית. את תוצאות בדיקת השקיפות העורפית משלבים בדרך כלל עם תוצאות בדיקת הסקר הביוכימי בשליש הראשון, וכך מגיעים לניבוי מדויק יותר.