יודקובסקי, ניצול גטו ורשה, עלה לישראל עם תום מלחמת העולם השניה. ל"ידיעות אחרונות" הצטרף כבר ב-1950, כעורך חדשות. הוא שימש כעורך העיתון במשך 36 שנה, מ-1953 ועד 1989, והפך אותו לעיתון הנפוץ והמוביל בישראל.
ב-1989 הוחלף על ידי ארנון מוזס במשה ורדי. ב-1990 יודקובסקי ייסד את בית הספר לתקשורת "כותרת". למשך שנתיים, מ-1991 ועד 1992, ערך את "מעריב". עם רכישת העיתון על ידי יעקב נמרודי, פרש יודקובסקי ממעריב, ולמעשה מעולם העיתונות בכלל.
בשנת 2000 זכה בפרס סוקולוב לעיתונות, ושנתיים לאחר מכן בפרס ישראל בתקשורת.