בעונת 1998/9, שנה אחרי שירד עם הפועל ב"ש לליגה השניה, בניון הפך לכוכב של ממש בכדורגל הישראלי - כשהוא בן 18 בלבד. בניון עזר למכבי חיפה להגיע לרבע הגמר גביע המחזיקות כשהוא וחבריו משאירים מאחור את גלנטורן, פ.ס.ז' וריד, כשהיהלום מציג יכולת אדירה שזיכתה אותו בזימון הבכורה לנבחרת של שלמה שרף.
ב-18 בנובמבר, כשהוא בן 18 וחצי, בניון עלה מהספסל בדקה ה-78 במקומו של אבי נמני וכבר הפך לחלק בלתי נפרד מהנבחרת. חודש לאחר מכן הכפיל הנער הצעיר את מספר הופעותיו כשנכנס בדקה ה-83 למשחק הביתי הראשון שלו במדי הנבחרת ב-0:2 מול יוגוסלביה.
ואז, ב-5 בספטמבר זה קרה. הנבחרת יצאה למשחק חוץ לא קל בקפריסין במוקדמות יורו 2000 ונקלעה לפיגור 2:1 בדקה ה-53. שלמה שרף הקפיץ מהספסל את בניון להופעה הרשמית הראשונה שלו, ובדקה ה-82 זה השתלם לו: אחרי בלאגן ברחבה הגיע הכדור לרגל ימין של מספר 15, שכבש ללא בעיות וסידר 2:2. לצערו, זה לא הספיק והמארחים ניצחו 2:3. ארבעה ימים חלפו, בניון קיבל את המספר 9 ופתח בהרכב לצד חיים רביבו ואלון מזרחי בדרך ל-0:8 על סן מרינו ושלושער לכוכב החדש של הנבחרת.
בגיל 19 וחצי בניון הפך לשחקן קבוע בנבחרת, אך רק בקמפיין מוקדמות מונדיאל 2006 הוא פרץ באופן סופי ולקח על הגב שלו את הנבחרת כמנהיג הבלתי מעורער שלה. ב-8 בספטמבר 2004 פיגרה הנבחרת 1:0 בבית מול קפריסין, אבל שער סולו בלתי נשכח של בניון סידר 1:1 ובהמשך קבע באדיר ניצחון חשוב.
חודש חלף, והכושר הטוב של בניון נמשך. "היהלום" התעלל בכל הגנת שווייץ בדרך ל-0:1 מהיר, שער שמוראט יאקין לא שכח עד היום, וגם לאחר שהכחולים-לבנים נקלעו ל-1:2 בניון היה שם כדי לכבוש שער נדיר ולסדר 2:2 – כנראה במשחקו הגדול ביותר במדי הלאומיים.
שלושער נוסף של בניון בתחילת ספטמבר 2010 נתן 1:3 על מלטה והעלה את מאזנו של קפטן הנבחרת ל-23 שערים, מקום שלישי משותף יחד עם רונן חרזי. ביוני 2011 הגיע שערו האחרון עד כה בנבחרת, ב-2:1 בחוץ על לטביה, שער שהעלה אותו למקום השני הכללי לצד שייע פייגנבוים עם 24 שערים לכל אחד.
רגע השפל של בניון היה ב-5 בספטמבר 2009, בדיוק 10 שנים אחרי שער הבכורה שלו בנבחרת. הקפטן הוחלף במשחק הביתי מול לטביה, במצב של 1:0 ללטבים, והחליף קללות עם עוזר המאמן משה סיני, בתקרית שכל הצדדים היו רוצים לשכוח.
הערב, 15 שנה פחות שלושה חודשים אחרי הופעת הבכורה שלו מול פורטוגל, בניון ייקח חלק במשחק מול אוקראינה, ישווה את שיא ההופעות של אריק בנאדו וינסה לעבור את שייע בטבלת מלך השערים עם שער ראשון במדי הנבחרת לראשונה מאז יוני 2011.
לא משנה אם הקפטן יעבור את בנאדו עד תום הקריירה, אם יכבוש שערים נוספים ואם יצליח להעפיל עם הנבחרת לטורניר גדול או לא – השורה התחתונה כבר ברורה לכולם: בניון הוא אחד הגדולים בהיסטוריה של הכדורגל הישראלי ושל הנבחרת.
