דגן חזר על עמדתו הקבועה לפיה תקיפה ישראלית באיראן הינה טעות אסטרטגית. "בעיקרון זה נכון למדינת ישראל להסתייג מכך שלאחד מאויביה יהיה נשק גרעיני. אבל הפצצה היא אמצעי שישיג במקרה הטוב השהייה, על פי מחקרים, לשלוש שנים. האם זו תקיפה שבשבילה שווה לישראל להיכנס למלחמה אזורית? עימות עם החיזבאללה, מעורבת במלחמה עם איראן ויש להניח שהסורים יצטרפו לחגיגה. אתה יודע איך זה מתחיל ולא איך זה יגמר. אני חושב שהשימוש בה צריך להיות אופציה אחרונה".
דגן: "העולם לא יסבול איראן גרעינית" | צילום: יעל צור, יח"צ "הבעיה האיראנית אינה מהווה אתגר רק למדינת ישראל. זהו אתגר לעולם כולו ולמזרח התיכון. היא מייצרת את מרכיב העימות המרכזי בין הסונים לשיעים, היא מייצגת את בעיית השליטה על מקורות האנרגיה, היא מערערת יציבות ומעודדת את הגורמים השיעים למציאות של חוסר יציבות במדינות כמו ירדן, כווית, איראן וסעודיה. בסוף, אם איראן תהיה חמושה בגרעין צבאי, ההשלכות יהיו בלתי נסבלות".
לשאלתו של אילון על עצם הדיון בנושא אמר דגן: "אני חושב שבחברה דמוקרטית צריך שיהיה דיון ציבורי בכל שאלות היסוד. למה מותר לדון כשהחמאס יורה קטיושות? למה זה לגיטימי לדון בבעיה הפלסטינית? אם כשהייתי בתפקיד הייתי מקבל הוראה חוקית לתקוף באיראן בניגוד לדעתי הייתי עושה את זה. אבל מהות החברה הדמוקרטית הוא דיון ציבורי ולכן אני חושב שבכל נושא שתהיה לי עמדה ויראה לי שהוא חשוב לביטחון המדינה, לא אשתוק".